Капсула постоянно транслирует все мысли и изменения в голове пилота на эту самую станцию с клоном какими-то офигительными волнами, которые экранируются тоже только чем-то очень офигительным. Что-то типо волн, по которым проходит наше общение в каналах

И так вот - именно прекращение трансляции мыслей служит сигналом для активации клона.
У лукъяненко там было чуть подробнее все это расписано и со своими подводными камнями, но мне лень все переписывать

