Так плексы и миссии это, как бы, разные вещи. Миссии берутся у агентов на станциях (есть, правда, и в открытом космосе некоторые товарищи). Запусти Поиск агентов - в руклиенте Адреса и координаты-Агенты-Поиск агентов, в параметрах поставь "показывать только доступных", а дальше уже ищи по фракции/корпорации/типу агентов и т.д.
Ну а плексы и аномалии - это то, что можно увидеть в "Разведзондах"(Alt-P). Аномальки видны сразу (ведь там же не только ёлки фракционные есть), а плексы нужно сканить пробками. После прохождения аномалек/плексов есть шанс выпадения экспедиций - тоже типа боевых плексов, только обычно состоят из нескольких этапов, ну и плюшки бывают всякие разные.
А на чем проходятся эти плексы?